上海深水港国际物流有限公司，位于中国（上海）自由贸易试验区同汇路1号，是由上港集团物流有限公司和上海同盛物流园区投资开发有限公司共同投资建立的专业物流服务企业，双方各出资50%，于2005年9月完成工商注册工作，于2005年12月与洋山码头同步开港运作。

上海深水港国际物流有限公司位于洋山保税港区范围之内，是洋山深水港码头的配套工程，公司主要由口岸查验区、辅助作业区、危险品作业区三个部分组成，总占地面积106.7万平方米。其中口岸查验区占地面积为61万平方米、辅助作业区占地面积为34万平方米、危险品作业区占地面积为11.7万平方米。

2005年10月28日深水港国际物流公司召开成立揭牌仪式，上海国际港务集团（股份）有限公司董事长陆海祜、上海同盛投资集团董事长刘作亮为新公司成立揭牌。